商标实质审查是商标注册主管机关对商标注册申请是否合乎商标法的规定所进行的检查、资料检索、分析对比、调查研究并决定给予初步审定或驳回申请等一系列活动。

拒绝商标注册的相对理由的审查，即审查申请的商标与在先权利是否的冲突，故也称新颖性审查。是指行政机关不仅要对申请材料的要件是否具备进行审查，还要对申请材料的实质内容是否符合条件进行审查。对于申请的实质审查，有的可以采取书面审查的方式，即通过申请材料的陈述了解有关情况，进行审查，但有的实质审查还需要进行实地核查，才能确认真实情况。

注册商标的流程：

1、企业准备将要注册的LOGO图样、公司营业执照复印件，并将这些资料交付知识产权代理机构。

2、知识产权代理机构相准备相关资料(代理委托书、申请书)

3、知识产权代理机构递交给国家商标局

4、国家商标局进行审查

5、国家商标局对此商标进行公告

6、国家商标局颁发证书

商标局收到申请件后，首先进行的是形式审查。

形式审查主要分三个部分：申请书件的审查(文件是否齐全、填写是否规范、签字/印章是否互缺少)、对商标图样规格、清晰程度及必要的说明的审查、分类审查(对填报的商品/服务项目的审查)。