股权确认之诉的流程如下：

1、当事人起诉，首先提交起诉书，并按对当事人人数提交相应的份数的副本。

2、原告向法院起诉应提交下列材料：

（1）原告主体资格的材料。如居民身份证；企业单位作为原告的应提交营业执照、商业登记证明等材料的复印件。

（2）证明原告诉讼主张的证据。如协议、章程、出资行为、出资证明书、股东名册、工商登记、承担其股东权利和义务的行为事实等。

3、当事人向法院提交证据清单。

4、立案庭在七天内，对符合立案条件的，办理立案手续；对不符合立案条件的，依法裁定不予受理。

5、当事人应在收到受理通知书之日起七天内预交案件受理费和其他诉讼费用。

6、立案手续后，案件由法院排期开庭。

办理需提交材料

1、公司清算组负责人签署的《公司注销登记申请书》（公司加盖公章）；

公司破产程序终结后办理注销登记的，由破产管理人签署。

2、公司签署的《指定代表或者共同委托代理人的证明》（公司加盖公章）及指定代表或者委托代理人的身份证件复印件；

应标明指定代表或者共同委托代理人的办理事项、权限、授权期限。

公司破产程序终结后办理注销登记的，由破产管理人签署。

3、人民法院的破产裁定、解散裁判文书，公司依照《公司法》作出的决议或者决定，行政机关责令关闭或者公司被撤销的文件；

4、股东会、股东大会、一人有限责任公司的股东或者人民法院、公司批准机关备案、确认清算报告的确认文件；

有限责任公司提交股东会确认决议，由代表三分之二以上表决权的股东签署。

股东会、股东大会、一人有限责任公司的股东或者人民法院、公司批准机关在清算报告上已签署备案、确认意见的，可不再提交此项材料。

公司破产程序终结后办理注销登记的，不提交此项材料。

5、经确认清算报告；

公司破产程序终结后办理注销登记的，不提交此项材料，提交人民法院关于破产程序终结的裁定书。

6、清算组成员《备案通知书》；

公司破产程序终结后办理注销登记的，不提交此项材料。

7、法律、行政法规规定应当提交的其他文件；

应提交《注销公告》证明（登报45天的报样）;

设有分公司的公司申请注销登记，还应当提交分公司的注销登记证明。

8、公司《企业法人营业执照》正、副本。

9、提交的申请书与其它申请材料应当使用A4型纸。

以上各项未注明提交复印件的，应当提交原件；提交复印件的，应当注明“与原件一致”并由企业登记机关加盖公章，或者由其指定的代表加盖公章或签字。

根据法定条件和程序，需要对申请材料的实质内容进行核实的，依法进行核实。

股权纠纷案件的处理方式有协商、调解、申请仲裁或者向法院起诉，如果通过司法途径处理股权纠纷案件，人民法院具体如何处理的这个问题不能一概而论，因为股权纠纷案件的类型非常多，法院审理股权纠纷案件的时候，肯定要参照国家相关法律制度。

1、当事人双方协商处理;

2、协商不成的可以请调解机构调解;

3、向仲裁机构申请仲裁或向法院提起诉讼。

对有限责任公司而言，在三种情况下股东不满股东会决议可以请求公司回购股东股权：

(一)公司连续五年不向股东分配利润，而公司该五年连续盈利，并且符合本法规定的分配利润条件的;

(二)公司合并、分立、转让主要财产的;

(三)公司章程规定的营业期限届满或者章程规定的其他解散事由出现，股东会会议通过决议修改章程使公司存续的。

对股份有限公司而言，在四种情况下可以回购股东股权：

1、减少公司注册资本;

股份有限公司想要减少公司注册资本，股东可以向股权转让给公司，让公司进行回购。

2、与其他持有本公司股权的公司合并;

必须是与其他持有本公司股权的公司合并时，公司才可以回购股东股权。

3、股份奖励给公司职工;

回购的股东股权必须奖励给本单位职工。

4、股东对股东大会作出的合并、分立决议持有异议。

股东对股东大会作出合并、分立的决议不能认可，可请公司回购所持有的股权。