保护改制企业小股东的合法权益有：
限制大股东的权利，避免其滥用权利。给小股东监督大股东提供更多的途径。根据相关法律规定，小股东有权行使查阅权，查阅公司账簿以及会议决议等。
依据《公司法》，公司股东应当遵守法律、行政法规和公司章程，依法行使股东权利，不得滥用股东权利损害公司或者其他股东的利益；不得滥用公司法人独立地位和股东有限责任损害公司债权人的利益。

股东权益纠纷处理方式如下：
一、调解；
坦诚、友好协商应是化解股东权益纠纷的最佳方式。当事人协商一致，且不违反法律、行政法规的强制性规定的，人民法院应予支持。
二、公司回购部分股东股份；
三、其他股东受让部分股东股份；
四、他人受让部分股东股份；
五、公司减资；
六、公司分立；
七、其他能够解决分歧，恢复公司正常经营，避免公司解散的方式。

尚未出资的股东是享有知情权的。
只要登记为股东，不论股东的贡献形式（现金、设备、知识产权、资源、个人能力等），均可享受股东权利，公司股东依法享有资产收益、参与重大决策和选择管理者等权利。
知情权是每个股东均享有的权利，无论持股比例高低。若是股东的知情权受到侵犯，可以起诉公司。根据相关法律规定，公司可以按照实缴比例分红，而不是认缴比例。

未参与经营管理的股东同样依法享有资产收益、参与重大决策和选择管理者的权利。
1、享有投资受益权，也称股利分配请求权。
2、按照实交的出资比例分取红利。
3、股东不得损害公司利益、不得侵害其他股东的合法权益，否则，应依法承担民事赔偿责任。
4、股东有权参与公司的经营管理。

认股人的权利、义务表现在：
认股人在认购股份时应填写认股书并按照所认股数缴纳股款;认股人必须在指定的时间向指定的代收股款的银行缴足股款;股款缴足后，有权要求银行出具收款单据。
认股人应按规定参加出席创立大会，行使创立大会规定的认股人的权利，通过创立大会了解公司设立情况的进展工作，选出公司的业务执行机关——董事会的成员及监督机关——监事会的成员，审查公司设立工作的财务状况，对有关的事项作出表决，表达自己的意愿，对公司不能设立作出决定。
对已作出批准的募股申请发现不符合法律规定，而又已经向社会公开募集股份的，认股人可以按照所缴股款并加算银行同期存款利息，要求发起人返还。

股东权益以诉讼方式解决如下：
1、股东请求阅览、复制公司章程、股东名册、管理人员名册、股东会议记录、财务会计报告、审计报告的，公司应当提供。
2、股东请求查阅、复制公司会计帐簿的，应当说明正当目的。
3、有限责任公司股东可以请求查阅董事会会议记录;股份有限公司股东请求查阅董事会会议记录的，应持有公司1%以上的股份。
4、股东因行使知情权受到阻碍，以公司为被告提起诉讼的，人民法院应予受理并作出裁定。
5、有限责任公司股东会决议公司合并、转让、实行股份交换、出租公司全部财产、对公司经营范围进行重大变更或者修改公司章程限制股份转让的，在股东会决议表决时投反对票的股东有权请求公司收购其股份。
6、公司连续五年或者五年以上盈利，且符合公司法规定的股东分配利润条件，但不分配利润的，在股东会决议表决时投反对票的股东有权请求公司收购其股份。
7、自股东会决议之日起60日内，股东与公司就收购股份协商不成的，股东可以在该期间经过后30日内，向人民法院提起诉讼;逾期起诉的，人民法院不予受理。
8、公司未依据公司法或者公司章程的规定召开定期股东会议的，股东有权请求人民法院裁定公司限期召开股东会议。
9、有限责任公司代表1/4以上表决权的股东，股份有限公司持有1/10以上股份的股东提议召开临时股东大会，公司不予召开的，提议股东有权请求人民法院裁定公司限期召开股东会议。
10、人民法院裁定公司召开股东会议的，应当限定股东会议的召开时间并指定公司法定代表人或者原告股东负责召集和主持会议。
11、下列情况下股东有权请求人民法院撤销股东会议决议：
(1)、股东会议的召集程序和表决方式违法或者违反公司章程规定的;
(2)、股东会议决议内容违反公司章程规定的。
12、股东主张撤销股东会议决议，应当自股东会议结束之日起2个月内提起诉讼;逾期起诉的，人民法院不予受理。

1、召集权

股东作为公司出资者，参与公司决策、选择管理者、决定资产分配方案等权利的实现途径就是参加股东会。

2、表决权

3、分红权

4、转让权

5、优先认购权

6、剩余财产分配权

7、知情权

8、诉权

股东可以查阅的资料的范围：
执行过程中，对于股东知情权案件中涉及到可以查阅资料的范围，包括股东会议决议记录和相关财会报表，而不包括形成这些记录或报表背后的原始材料或数据。但是，随着公司法立法不断趋向于规范公司运作和保护中小股东权益的发展，进一步规范、完善股东会议的记录内容，有利于股东对公司经营决策事项的形成过程有更明确的了解，从而保护那些无法参与公司经营决策的中小股东的权益。同时，详细、规范的会议记录有利于公司机构经营运作的正常化和加强对管理层的权力监督。至于记录内容可能涉及到公司商业秘密的问题和股东享受知情权后对公司商业秘密的保密责任问题，则可以另外设计可行的解决方法。

股东参与公司经营管理权主要包括：
（1）、重大问题决策权。
股东通过大会决定公司的重大事项，如投资计划，增加注册资本，合并等。
（2）、建议或质询权。
依据《公司法》规定，股东有权查阅公司章程、股东名册、公司债券存根、股东大会会议记录、董事会会议决议、监事会会议决议、财务会计报告，对公司的经营提出建议或者质询。

股东查账权的行使流程是：
1、有意查账的股东应当向公司提出书面申请，说明查账目的，并在请求书中说明查账的具体原因和目的；
2、公司对股东查账目的进行实质性审查。拒绝的理由仅限于股东查阅会计账簿的不正当目的，可能损害公司的合法利益。此外，公司没有其他理由拒绝。公司拒绝的，应当在十五日内答复并说明理由，或者在此期间向股东提供会计账簿；
3、公司拒绝提供咨询的，股东可以请求人民法院要求公司提供咨询。如遇重大紧急情况，可向法院申请对公司账簿采取诉讼保全措施。