二者含义不同
商标变更是指商标注册人对其名义、地址、代理人等注册事项所作出的变更。变更注册人名义只是同一主体称谓发生改变，商标权利没有转移。比如原来商标持有人店铺地址或个人名字发生更改，但是商标权利人还是同一个。
商标转让不同，商标转让是权利人根据自己意愿，按照法定程序转让自己享有的注册商标权给他人。商标转让是在不同主体之间发生的商标权利转移，存在法定的权利分界时间，受让人自商标转让核准公告之日起享有商标专用权。
其中最明显的就是权利人主体个数：变更是一个主体信息变更，而转让是两个主体之间权利转移。
二者程序不同
商标变更需向商标局提交变更申请书，还需提交有关登记机关出具的变更证明文件。商标变更是由商标注册人一方提出，当商标局收到申请材料后，受理通知书发送给商标注册人。
而且在变更时，需要将商标注册人的全部注册商标一起变更，没有一起变更的，商标局会通知限期改正，期满不该，就当作你放弃变更，会书面通知。
商标转让是指转让人和受让人应当签订转让协议，并共同向商标局提出申请。受让人应当保证使用该注册商标的商品质量。在这个过程中，商标转让申请是由双方共同提出，商标局发出的受理通知也是向连两者同时发出。
《商标法》规定，转让注册商标的，商标注册人对其在同一种商品上注册的近似商标，或者在类似商品上注册的相同或者近似的商标，应当一并转让。
