在法律实践中，普通股权的转让价格通常由以下几种方式确定：
(1)当事人自由协商确定，即股权转让时，股权转让价款由转让方与受让方自由协商确定，可称为“协商价法”。
(2)以公司工商注册登记的股东出资额为股权转让价格.可称为“出资额法”。
(3)以公司净资产额为标准确定股权转让价格，可称为“净资产价法”。
(4)以审计、评估的价格作为依据计算股权转让价格，可称为“评估价法”。
(5)以拍卖价、变卖价为股权转让价格。
1、股权转让协议和增资协议的合同当事人虽然都含有公司的原股东及出资人，但从协议价金受领的情况看，股权转让协议和增资协议中出资人资金的受让方是截然不同的。股权转让协议中的资金由被转让股权公司的股东受领，资金的性质属于股权转让的对价，原股东的权利和义务由股权受让方承继。而增资协议中的资金受让方为标的公司，而非该公司的股东，资金的性质属于标的公司的资本金，原股东的权利义务不一定改变。
2、股权转让协议和增资协议支付价金一方的当事人对于标的公司的权利义务不同。股权转让协议中，支付价金的一方在支付价金取得了公司股东地位的同时，不但继承了原股东在公司中的权利，也应当承担原股东对公司从成立之时到终止之日的所有义务，其承担义务是无条件的。而增资协议中支付价金一方的投资人是否与标的公司的原始股东一样，对于其投资之前标的公司的义务是否承担，可以由协议各方进行约定，支付价金的一方对其加入该公司前的义务的承担是可以选择的。
3、从出资后，标的公司的注册资本的变化看，股权转让协议签订后，只涉及股权转让方与股权受让方，出资人履行义务完成时标的公司的注册资本是保持不变的，仍然为原数额。而增资协议签订后，标的公司的注册资本会增加。
另外股权转让和增资扩股的计税也有所不同，增资扩股：原股东股权计税成本不变，虽然原股东的股权有可能被稀释，但不调整原股权的计税基础，对股东的投资款不征收企业所得税。股权转让：原股东股权计税成本调整，原股东出让股权给受让方，取得股权转让收入扣除股权的计税成本及相关税费确认“财产转让所得”征收所得税，同时根据股权转让的比例调整原股东股权的计税基础。
