公司有债权债务纠纷的情况下，是不可以注销的。

公示注销应当先进行清算，公司的财产不能清偿所有债务的，就会进行破产清算，如果破产企业没有可供分配的财产时，破产清算就会结束，可以注销公司。未经依法清算即被注销的，以该企业法人的股东、发起人或者出资人为当事人。我国《公司法》规定，清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，发现公司财产不足清偿债务的，应当依法向人民法院申请宣告破产。

公司被依法宣告破产的，依照有关企业破产的法律实施破产清算。

一、公司受让股权召开公司股东会，研究收购股权的可行性，分析收购股权的目的是否符合公司的战略发展，并对收购方的经济实力经营能力进行分析，严格按照公司法的规定程序进行操作。

二、聘请律师进行律师尽职调查。

三、出让和受让双方进行实质性的协商和谈判。

四、评估、验资(私营有限公司也可以协商确定股权转让价格)。

五、股权转让的公司召开股东会，并形成股东会决议，免去转让方股东的相关职务，表决比例和表决方式按照原来公司章程的规定进行，参加会议的股东在《股东会决议》上签字盖章。

六、向股东以外的第三人转让股权的，由转让股权的股东向公司董事会提出申请，由董事会提交股东会讨论表决;股东之间转让股权的，不需经过股东会表决同意，只要通知公司及其他股东即可。股东对股权转让给第三方放弃优先购买权，出具放弃优先购买权的承诺或证明。

七、双方签订股权转让协议，对转让股权的数额、价格、程序、双方的权利和义务做出具体规定，使其作为有效的法律文书来约束和规范双方的行为。

八、需要召开新股东会议，经过新股东会表决同意，任命新股东的相关职务，表决比例和表决方式按照公司章程的规定进行，参加会议的股东在《股东会决议》上签字盖章。讨论新的公司《章程》，通过后在新的公司《章程》上签字盖章。

九、收回原股东的出资证明，发给新股东出资证明，对公司股东名册进行变更登记，注销原股东名册，将新股东的姓名或名称，住所地及受让的出资额记载于股东名册，并相应修改公司章程。但出资证明书作为公司对股东履行出资义务和享有股权的证明，只是股东对抗公司的证明，并不足以产生对外公示的效力。

十、将新修改的公司章程，股东及其出资变更等向工商行政管理部门进行工商变更登记。有关法律规定，有限责任公司股东转让股权的，应当自转让股权之日起30日内申请变更登记，并应当提交新股东的主体资格证明或者自然人身份证明。

股权转让变更工商登记的意义主要有：

1、股权转让变更工商登记的法律意义。依据法律规定，公司应当在股东发生变更之日起30日内到工商行政管理机关办理变更登记。这种登记起到一种公示作用，登记之后可以对抗善意第三人，反之，不能对抗善意第三人。

2、股权转让合同的成立与生效。股权转让合同的成立自双方达成一致意见时成立，可以是书面合同，也可以是非书面合同形式的。

公司注销前会进行清算，清算后剩余的财产，包括债权会分配或者转让给股东，此时股东就获得了公司债权，就可以以自己的名义追讨债务了。

可能会有法律风险，未未办理股东变更登记可能会造成变更登记无效。

有限公司变更股东、有限公司的股东改变姓名或者名称的，应当自发生变动之日或改变之日30日内申请变更登记。虽然在公司法对股权转让应办理相应变更手续的要求下，但股权转让协议的生效并不当然导致股权发生变动。反之，股权未能发生变动也并非意味着股权转让协议未生效。

虽然公司工商变更登记不影响股权转让协议的效力，但由于变更登记会产生对抗第三人的法律效果，而且就现今由于股权转让未办理工商变更登记的争议也非常多，故建议在股权转让后应依据公司法及相关规定的要求尽快办理相应的变更登记，只有办理完所有的变更要求后，一个股权转让行为才算完全、彻底。