第一步：申请人登录原发证的食品药品监督管理部门申报端或省级食品经营许可管理系统（网上申请），填写《食品经营许可注销申请书》并附相关申请材料。

第二步：申请人向原发证的食品药品监督管理部门提交申请资料，材料齐全、符合法定形式的，予以受理；申请材料存在可以当场更正的错误的，允许申请人当场更正；申请材料不齐全或者不符合法定形式的，应当场或者在五个工作日内一次性告知申请人需要补正的全部内容。

第三步：符合条件的，依法作出准予许可的书面决定；不符合条件的依法作出不予许可的书面决定，在说明理由的同时，告之申请人享有依法申请行政复议或提起行政诉讼的权利。

第四步：申请人到原发证的食品药品监督管理部门食品药品监管局窗口领取《准予注销通知书》或不予注销决定书。

食品经营许可证办理可以到辖区食品药品监督管理所去递交申请书申请办理，或者委托专业的代理公司帮助办理。

办理流程：

1、先申请营业执照：任何店在经营的时候都必须有基本的营业执照。如果想要进行食品经营许可证办理，那么食品店的营业执照是很重要的，具备了营业执照才能够申请。

2、在当地的食品监督部门提交申请：进行食品经营许可证办理的时候需要在食品监督部门提交相关的申请，基本的申请通过了之后，才会颁发食品经营许可证。

3、提交资料：办理食品经营许可证的时候必须是实名制的，如果不是实名制就不能够申请。所以，申请的过程中必须要有的资料是本人身份证。

4、开始办理：将以上这三个步骤完成之后，就可以办理食品经营许可证（办理食品经营许可证，要提供你的营业执照，还需要健康证明（不少于两个）），然后经营自己的食品店。

经营许可证是法律规定的某些行业必须经过许可，而由主管部门办理的许可经营的证明，如烟草专卖许可证、药品经营许可证、危险化学品经营许可证等。不同的许可证有不同的主管部门办理，如食品经营许可证去当地食品药品监督管理部门办理。食品经营许可证在当地市场监督管理局办理，办理不收费。完成业务的一般法定时限为20个工作日，但申请人补充材料、整改、现场检查、依法听证、检查、测试和鉴定的时间不包括在承诺的时限内。

县级及其以上地方工商行政管理机关是食品流通许可的实施机关，具体工作由负责流通环节食品安全监管的职能机构承担。地方各级工商行政管理机关的许可管辖分工由省、自治区、直辖市工商行政管理局决定。食品流通许可应当遵循依法、公开、公平、公正、便民、高效的原则。