一、双方转让标的的称谓不同，因此主体双方的权利义务关系有区别。

1、有限责任公司转让股权实行严格的限制转让制度。对内主让与对外转让做了明显的区别：内部转让股权比较自由;对外转让股权实行严格限制，必须经全其他股东的过半数同意，经股东同意转让该股权，在同等情况下股东享有优先购买权，实行转让登记制度。

2、股份有限公司转让股权现对简单，实行自由转让。无论转让给内部股东还是外部投资者，都采取自由转让。但是法律也对股份转让作了一定的限制：

(1)发起人持有的本公司股份，自公司成立之日起一年内不得转让。公司公开发行股份前已发行的股份，自公司股票在证券交易所上市交易之日起一年内不得转让。

(2)公司董事、监事、高级管理人员应当向公司申报所持有的本公司的股份及其变动情况，在任职期间每年转让的股份不得超过其所持有本公司股份总数的百分之二十五;所持本公司股份自公司股票上市交易之日起一年内不得转让。上述人员离职后半年内，不得转让其所持有的本公司股份。

(3)公司不得收购本公司股份。但有法律规定的除外。

(4)交易场所，股东转让其股份应当在依法设立的证券交易场所进行或者按照国务院规定的其他方式进行。

二、两者实质不同，因此两者转让的行为不同。

1、有限责任公司的股权转让是不完全独立的自由转让，原因是除了具有资合性，还具有较强的人合性。也是由于较强的人和性，有限责任公司的转让具有一定的封闭性，即对内开放，对外限制。

2、股份有限公司的股份转让，股份有限公司的股份转让是独立的转让，其本质是股份有限公司是完全的资合性公司。

一、印花税

首先引出的是印花税。股权转让要签股权转让合同或协议，而法规规定交易合同是需要贴花缴纳印花税的。

印花税纳税义务人为立据人，即转让人和受让人。换句话说，印花税是对签订股权转让合同的双方征收的，双方都需要缴印花税。

需要注意的是，被投资企业不用缴印花税，也没有代扣代缴的义务，由股权转受双方自己完成。

二、企业所得税

如果是以公司主体转让股权，就会涉及到企业所得税问题。企业所得税相对于印花税这种小税种来说，还是比较占大头的.企业所得税，当然是企业缴啦！只要符合下面两种条件，持股人（即转让方）就要缴。

①持股主体是企业，转让给个人；

②持股主体是企业，转让给企业。

注意跟印花税区分哦！印花税双方都缴，所得税只有转让方缴！