究其原因，除了商标查询是建立在自愿原则基础上，而非商标注册申请程序中法定程序的原因以外，主要在于其查询结果无法百分百保证其全面性和准确性。换言之，即使进行了商标查询工作，也无法绝对保证注册成功率或不会存在主动/被动侵权风险。而之所以无法保证查询结果的全面性和准确性，主要源于客观存在的以下两点因素。
1.商标近似度判断具有一定的主观因素
关于商标的近似度判定，虽然有《商标审查及审理标准》等指导性文件可供参考，然而针对商标标识的整体外观、视觉效果等较为抽象的概念进行分析时，包括各个代理机构从业人员以及商标局的审查员在内，个人的经验积累、专业能力高低均有所不同，很有可能会得出截然相反的意见。
但总体上而言，代理机构经验丰富的从业人员在长期处理大量各种不同类型的商标案件中，能够接触到商标局发出的各式各样的意见、通知，通过长时间对于官方文件的理解和掌握的经验积累，相较于企业而言，经验丰富的代理机构对于商标近似性的判断会更为全面、更接近商标局的标准。
2.查询结果有盲区
商标局公布的数据信息更新往往有3-6个月的滞后性，那就意味着，在商标局官网上进行商标查询时，得到的查询结果很可能无法包含查询当天及之前3-6个月内的他人申请商标，而这将会直接影响到查询结果的完整性和准确性。申请人只能寄望于在无法能查询到的数据中不存在他人的相同或近似商标。
基于《商标法》第三十一条“两个或者两个以上的商标注册申请人，在同一种商品或者类似商品上，以相同或者近似的商标申请注册的，初步审定并公告申请在先的商标；同一天申请的，初步审定并公告使用在先的商标，驳回其他人的申请，不予公告。”的规定，在查询日及之前3-6个月内的无法查询到的在先商标申请中，如若存在他人的相同或近似在先商标申请，那么申请人的在后申请势必将被驳回。
由于申请人完全可以自行登录商标局官网，免费进行商标查询工作，许多企业往往为了节约成本和时间，自行进行查询工作。
但是在这里，小鱼建议申请人最好能够委托正规专业的代理机构进行查询工作，原因在于虽然“商标查询”看似是一项可以自行通过商标网免费完成的工作，但实际上由于缺乏足够的经验，一旦在查询的各个环节中稍有偏差例如：对商标的近似判断、显著性判断等，将会导致商标申请提交的9个月后的注册结果失之毫厘，差之千里。
此外，在委托代理机构进行查询的情况下，专业的代理机构不仅会查询商标的在先权利障碍，还会首先就申请商标本身的可注册性给予专业建议。如此还能避免发生明明不存在在先障碍商标，但申请却由于商标标识本身的显著性等绝对性条款理由而被驳回，导致最终无法获得注册的情况。
由于商标查询存在3-6个月左右的盲区，申请人在提交商标注册申请后6个月左右，最好能够进行再一次的查询确认，从而可以更为准确地把握和判断注册申请的成功可能性，一旦发现在先权利障碍的存在，也能够在第一时间调整商标标识提交新申请，乃至转变企业战略方针。相较于申请提交的9-10个月后收到商标局发出的《商标驳回通知书》才知晓商标无法获得注册的情形，如果能够更早地了解到商标获得注册的可能性非常低，进而及时调整战略方针，将会大幅节约时间和金钱成本，避免造成更大的实际经营损失。
