1、投资主体不同:有限责任公司投资主体可以是自然人，也可以是法人;而个人独资企业的投资主体只有一个人，就是自然人。责任由自己独资承担。
2、法律形式不同:有限责任公司属于法定民事主体，具有法人资格，个人独资企业不具有。
3、税收缴纳规定不同:有限责任公司需要缴纳企业所得税，个人独资企业不需要缴纳，需要缴纳个人所得税。
4、投资者承担责任不同:有限责任公司股东以认缴的出资额为限承担“有限责任”个人独资企业的投资人以其个人资产对公司承担无限责任。

分公司并不具备独立的民事主体资格，其违法应该由总公司来承担法律责任及不利后果。
具体来说，分公司并不能够独立的承担民事责任，因此也不能够在民事诉讼之中充当被告的地位，必须要和总公司一起担当被告，分公司是不能够独立承担责任的。
这种情况下可以找总公司来进行处理。总公司需要对分公司的行为承担后果及责任。

公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。
这一规定，明确了分公司民事责任的归属，即分公司不能独立承担民事责任，其一切行为的后果及责任由隶属公司承担。
企业法人的分支机构 经营管理的财产不足以承担保证责任的，由企业法人承担民事责任。

公司股权的分配根据具体情况而定。一般是根据股东各自出资金额占的比例计算出来的，股权比例也是可以约定的,有限公司的股东可以约定表决权，分红权的比例，可与股权比例不一致。如果其中有技术入股或者专利入股的,需要将其技术折算成资金，再重新进行分配。股权分配是现在有股东不需要向公司支付额外的现金，仍可以获得公司新股票的股票发行方式。