1.股东出资纠纷。通常是股东在公司设立或增资过程中，因履行向公司投入钱或物等资本而发生的纠纷。在司法实践中，主要表现在股东虚报出资额或先出资后抽逃等情形。

2.股权确认纠纷。表现为因股东资格而产生的股权确认纠纷，主要存在于有限责任公司，股份有限公司股东资格以持有的股票为认定标准，一般不存在异议。

3.股权转让纠纷。为最常见的纠纷类型，即股权在转让过程中所发生的纠纷，包括股东之间转让股权的纠纷，以及股东与非股东之间转让股权的纠纷。

4.股东权利纠纷。一般表现为企业财产的一个或多个权益所有者拥有哪些权利和按什么方式、程序来行使权利过程中所发生的纠纷。

(一)净资产核定法

股权的转让收入按照每股净资产或股权对应的净资产份额核定。

被投资企业的土地使用权、房屋、房地产企业未销售房产、知识产权、探矿权、采矿权、股权等资产占企业总资产比例超过20%的，主管税务机关可参照纳税人提供的具有法定资质的中介机构出具的资产评估报告来核定股权的转让收入。

6个月内再次发生股权的转让且被投资企业净资产未发生重大变化的，主管税务机关可参照上一次股权在转让时被投资企业的资产评估报告核定此次股权的转让收入。

(二)类比法

1、参照相同或类似条件下同一企业同一股东或其他股东股权的转让收入核定;

2、参照相同或类似条件下同类行业企业股权的转让收入核定。

(三)其他合理方法

主管税务机关采用以上方法核定股权转让收入存在困难的，可以采取其他合理方法核定。

相关知识：可以核定的股权转让收入的情形

(一)申报的股权转让收入明显的偏低且无正当理由的;

(二)未按规定期限办理纳税申报的，经税务机关责令限期申报的，逾期仍不申报的;

(三)转让方无法提供或拒不提供股权转让收入的有关资料;

(四)其他应核定股权的转让收入的情形。

可以视为股权转让收入明显偏低的情形：

(二)申报的股权转让收入低于初始投资成本或低于取得该股权所支付的价款及相关税费的;

(三)申报的股权转让收入低于相同或类似条件下同一企业同一股东或其他股东股权的转让收入的;

(四)申报的股权转让收入低于相同或类似条件下同类行业的企业股权的转让收入的;

(五)不具合理性的无偿让渡股权或股份;

(六)主管税务机关认定的其他情形。

需要。股权是可以通过转让的方式出售的，当股权转让的时候，必然会涉及到大笔的资金流动，这时还涉及到税费的问题。股权转让是需要缴税的。需要缴纳的税费包括：

1.如果转让方是个人，要交纳个人所得税，按照20%缴纳；

2.内资企业转让股权涉及的税种，公司将股权转让给某公司，该股权转让所得，将涉及到企业所得税、营业税、契税、印花税等税费的问题。

不用交税，以转让款项作为公司实缴资本的话，是合法的。

申报的股权转让收入明显偏低且无正当理由的，主管税务机关可以核定股权转让收入。申报的股权转让收入低于股权对应的净资产份额的，视为股权转让收入明显偏低。主管税务机关应依次按照净资产核定法、类比法以及其他合理方法核定股权转让收入。以现金出资方式取得的股权，按照实际支付的价款与取得股权直接相关的合理税费之和确认股权原值。

1、个人转让股权的所得属于财产转让所得项目，以转让财产的收入额减除财产原值和合理费用后的余额，为应纳税所得额，按20%税率缴纳个人所得税，按次征收。

2、股权转让所得应缴纳的个人所得税＝（股权转让收入－取得股权所支付的金额－转让过程中所支付的相关合理费用）×20%.自然人转让所投资企业股权（份）取得所得，应当按照公平交易价格计算并确定计税依据。

3、财产转让所得，是指个人转让有价证券、股权、建筑物、土地使用权、机器设备、车船以及其他自有财产给他人或单位而取得的所得，包括转让不动产和动产而取得的所得。对个人股票买卖取得的所得暂不征税。