是。
依据我国相关法律的规定，当事人是可以在协议中约定专利权的，当事人在协议中约定了专利权的，专利权的归属按协议约定处理。
《中华人民共和国专利法》
第八条两个以上单位或者个人合作完成的发明创造、一个单位或者个人接受其他单位或者个人委托所完成的发明创造，除另有协议的以外，申请专利的权利属于完成或者共同完成的单位或者个人;申请被批准后，申请的单位或者个人为专利权人。
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