股权纠纷案件的处理方式有协商、调解、申请仲裁或者向法院起诉，如果通过司法途径处理股权纠纷案件，人民法院具体如何处理的这个问题不能一概而论，因为股权纠纷案件的类型非常多，法院审理股权纠纷案件的时候，肯定要参照国家相关法律制度。
1、当事人双方协商处理;
2、协商不成的可以请调解机构调解;
3、向仲裁机构申请仲裁或向法院提起诉讼。
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