公司股权纠纷的处理方式有协商、调解、仲裁和诉讼，具体如下：
1、协商，纠纷发生后，双方当事人可以协商处理；
2、调解，当事人可以寻找有关组织进行调解；
3、仲裁，存在仲裁协议或者约定仲裁的，可以去仲裁机构进行仲裁，由仲裁机构出具仲裁书；
4、诉讼，当事人可以去人民法院递交起诉状，提起民事诉讼，由人民法院对纠纷进行立案审理。
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