股份转让协议的注意事项主要是：
1、明晰股权结构，应就被转让公司的股权结构作详尽了解;
2、进行评估，确认转让的份额后，应请国家认可的资产评估所对被收购公司的资产及权益进行评估，出具评估报告;
3、确定股权转让总价款;
4、保证出让方主体资格合法，转让股权有关的活动中所提及的文件均合法有效，没有损害他人利益等。
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