总公司法人变更了分公司合同有效吗

有效。虽然总公司法人变更了，但在法人变更前签订的合同不因法人变更而失效，当事人要继续履行合同义务，所以分公司的合同仍然有效的。《民法典》第七十四条规定：“法人可以依法设立分支机构。法律、行政法规规定分支机构应当登记的，依照其规定。分支机构以自己的名义从事民事活动，产生的民事责任由法人承担；也可以先以该分支机构管理的财产承担，不足以承担的，由法人承担。”