运输途中货物的损失应该由商业公司承担。
根据相关规定:“标的物需要运输的,出卖人将标的物交付给第一承运人后,标的物毁损、灭失的风险由买受人承担。”“当事人没有约定交付地点或约定不明确,标的物需要运输的,出卖人应当将标的物交付给第一承运人以运交给买受人。”