企业支出的举证责任应当由税务机关承担吗

应当。

税收行政诉讼举证责任规定是行政机关对于所作出的具体行政行为是负有举证责任的。根据规定:“被告对作出的具体行政行为负有举证责任。应当提供作出该具体行政行为的证据和所依据的规范性文件。”税务机关提供的证据来源于行政执法过程，其证据形成具有固定性。行政诉讼中举证规则的最大特点是被告承担举证责任，税务行政诉讼也不例外。但实际上，大量行政、课税资料多由纳税义务人(即税收债务人)掌握,同时税务行政诉讼需证明事项其技术性较高，将其证明责任完全归咎于行政机关(即债权人)一方不符合实际，同时也有损公平原则和效率原则。