中标合同补充协议对中标合同价款进行了变更可以吗

可以。

在招标活动中，招标文件中的合同文本往往包含着一些合同的变更条款，并约定了变更规则。如由于不可抗力、变更估价、承包人的合理化建议、物价波动、法律变化等原因引起的价格调整从而引发合同实质性内容变更的情况是被允许的，只要建设工程招标文件中约定了相应变更条款，价款、工期等调整就可依据招标文件约定进行变更。此种约定在招标活动开始时便公平公开的展现在每一位投标人面前，且未损害其他未中标人的合法权益和社会公共利益，因此应当是正当的变更。