高新技术企业认定的程序如下：
（一）企业自我评价及申请企业登录“高新技术企业认定管理工作网”，对照本办法第十条规定条件，进行自我评价。
认为符合认定条件的，企业可向认定机构提出认定申请。
（二）提交申请材料
（三）合规性审查认定机构应建立高新技术企业认定评审专家库；
依据企业的申请材料，抽取专家库内专家对申报企业进行审查，提出认定意见。
（四）认定、公示与备案认定机构对企业进行认定。
经认定的高新技术企业在“高新技术企业认定管理工作网”上公示15个工作日，没有异议的，报送领导小组办公室备案，在“高新技术企业认定管理工作网”上公告认定结果，并向企业颁发统一印制的“高新技术企业证书”。
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