1、适用的法律不同。破产清算应依《破产法》的程序进行,自行清算则依《公司法》的程序进行。
2、清算原因不同。破产清算是由于公司资不抵债导致公司解散而进行的清算,而自行清算则是除公司破产等原因以外的情形导致公司解散而为的清算。
3、清算机关不同。破产清算由法院组织管理人进行,而自行清算则主要由公司股东依法组建。我国《公司法》对有限责任公司和股份有限公司作出了不同的规定。
4、确认程序不同。破产清算必须由法院确认,而自行清算则主要由股东或股东代表确认。