医药公司分立能否免除拖欠药品货款的违约责任

不能。
公司分立后债务怎么承担
(一)公司与债权人没有特别约定
公司与债权人没有特别约定，债务由分立后的公司承担连带责任。
1、新设分立的债务归属。所谓新设分立，就是将原公司法律主体资格取消而新设两个及以上的具有法人资格的公司。即原公司不再存在，取而代之的是新生的两个公司。
2、派生分立的债务归属。派生分立是指原公司法律主体仍存在，但将其部分业务划出去另设一个新公司。就是说，原公司仍存在，只是规模减小增加一家新公司。
(二)公司与债权人有债务归属约定
在分立前债权人得知公司即将分离后，可以与公司就债务承担达成协议，约定债务由其中一家公司偿还或者其他偿还方式。这种情况下债务的承担与法律规定略有不同。