上下班途中发生交通事故责任无法确定，是否影响公司进行工伤认定

需分情况分析。
在认定交通事故责任时，对于单方事故而言，由于交通事故责任主体是单方的，对受伤(亡)职工来说举证责任要严于多方事故，因“其它承担主要责任主体”不明，对提出工伤认定一方的举证责任在没有其它原因力影响之下，行为人应当对事故承担主要责任。
对于双（多）方事故而言，参照“优者危险负担”原则确定责任承担，并结合行为人有无酒驾、逃逸、车证是否完备等因素进行综合判断。