公司与员工在解除合同上的主要纠纷有哪些

两个方面，从劳动者来说主要是违法解除劳动合同、支付经济补偿金、支付加班工资、未签订书面劳动合同的事实劳动合同关系解除等;而从公司来说公司主要是希望在合法而尽量少支付补偿金的情况下与劳动者解除劳动合同。
两者的出发点和目的不同，关注的点也会不同，通常情况下小企业由于没有专业的规范化管理常常会出现违法解除的情形，而劳动者在解除合同的过程中碰到的问题和情形就比较多样，要视具体情况而定，但劳动者的首要前提是要有维权的意识，懂得劳动法律规范中关于解除合同的规定。