工程欠款和解协议书是否有效要看约定内容是否合法,签订过程是否不存在欺诈胁迫等有违自愿原则的情况,如果和解协议内容不违反强行法规定,签订过程不存在有违自愿原则的情况下,且此和解协议不会损害公共利益,国家利益,那就可以认定有效。因为工程欠款和解协议书作为一种民事协议,只要是出自于双方当事人的真实意思表示,就是合法有效的。