实质性区别就是是否可以抵扣。专用发票有抵扣联,必须通过专用开票机或者通过税局代开,通过认证并符合条件的可以用于进项税抵扣。而普通发票不行。
当然,专用发票不是唯一可以进行进项抵扣的凭证。
为了满足抵扣认证的需要,增值税专用发票都是有固定样式的。