医疗器械行业进项是可以抵扣的。不管什么行业只要取得专用发票用于增值税可以抵扣的范围，都可以抵扣。
分为一般纳税人和小规模纳税人。
一般纳税人:按照专用发票上注明的增值税额:
借记"应交税金--应交增值税(进项税额)"科目;
按照专用发票上记载的应计入采购成本的金额:
借记"材料采购"、"商品采购"、"原材料"
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