对于选择专利保护与商业秘密保护两种保护方式的进行选择的方法如下：
1、已经公开的、周期长的，适宜选择专利保护；
2、不属于专利法保护、创造性高度不够、公开容易造成损失的客体，适宜选择商业秘密保护；
3、选择专利保护与商业秘密保护的其他确认方式。
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