修改公司章程的程序有：
1、公司董事会应当作出修改公司章程的决议，并提出修改公司章程的草案；
2、股东会表决修改章程的条款。有限责任公司修改公司章程，必须经代表三分之二以上表决权的股东批准，股份有限公司修改章程，必须经出席股东大会的股东持有的表决权的三分之二以上批准；
3、修改公司章程涉及需要审批的事项时，应当报政府主管部门批准。股份有限公司为注册资本发行新股的，必须向国务院授权的部门或者省级人民政府申请批准，公开募集的，经国务院证券管理部门批准；
4、修改公司章程涉及登记事项的，报公司登记机关批准，办理变更登记，未涉及登记事项的，送公司登记机关备案；
5、修改公司章程需要公告的，应当依法公告。
如果公司发行新股，必须按照法定或公司章程规定的方式公告。
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