一、应缴纳所得税的计算依据不同。
1、公司制企业按应纳税所得额计算缴纳企业所得税;
2、个人独资企业应个体工商户生产经营所得计算缴纳个人所得税;
3、合伙企业应缴纳个人所得税,并实行先分后税,由投资者分别缴纳个税。
二、合伙企业、个人独资企业、个体工商户一般情况下均涉及缴纳增值税、城建税、教育费附加、地方教育费附加以及印花税。
1.增值税纳税人方面,以上组织形式均可能是一般纳税人或小规模纳税人,增值税纳税人身份的划分与组织形式无关,是根据年度应税销售额进行划分的,所以个体工商户以及个人独资企业同样可能是一般纳税人。
2.所得税方面不同,公司均有独立法人资格,公司层面需要缴纳企业所得税,符合小微企业标准的(从事国家非限制或禁止行业,且资产总额不超过5000万,从业人数不超过300人,应纳税所得额不超过300万)可以享受小微企业的优惠政策。公司分配给自然人股东的分红,自然人股东需要缴纳20%分红个税,股东是法人的,居民企业之间的分红可以享受分红免税的优惠政策。