通常情况下，造成代理记账费用差异，主要是受以下几方面影响：
（1）城区差异
由于不同城区经济发展水平不同，因此对于代理记账费用收取也会存在一定的差异。通常，经济越发达的城区，代理记账价格也会越高。
（2）企业规模
在现实生活中，规模越大的企业，其账务处理越复杂，因此对企业记账报税专业性的要求就越高。所以，规模较大的企业相对于小公司来讲，其代理记账费用也会相对高些。
（3）企业纳税人类型
当前，我国企业可分为小规模纳税人和一般纳税人两种。对于小规模纳税人企业来说，由于其记账报税相对简单，因此其代理记账收费相较于一般纳税人来说要便宜一些。
（4）开票情况
在企业经营运转过程中，不同的企业开具和收取的票据量不同。有些企业业务较少，票据量小，所以代理记账费用也较低。而有些企业业务繁多，票据量大，所以代理记账费用也会相应增高。
（5）计费形式
目前市面上代理记账计费形式主要分为两种，一种按月计费，一种是按年计费。但整体来看，企业选择按年度收费的代理记账公司，其费用收取相较于月度来说要更划算一些。
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