企业投资项目备案流程如下：
1、项目单位必须首先向发改委等备案管理部门办理备案手续；
2、备案后分别向城乡规划、国土资源和环境保护部门申请办理规划选址、用地和环评审批手续；
3、最后，依据相关批复文件，向建设主管部门申请办理项目开工手续。
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