行政机关根据缺失情况进行股权变更登记的,应当撤销股权变更登记。
公司通过提交虚假股权转让协议和股东大会决议骗取股权变更登记,违反有关公司登记的有关规定。行政机关的变更登记,即使形式合法,本质上也是违法的。因事实虚假,符合具体行政行为主要证据不足的法律情形,法院判决撤销股权变更登记。