股东协议是公司内股东之间的协议，个人合作协议是更纯粹的个人协议，之间存在的较明显的区别。
1、股东协议是股东之间的协议，基础是双方都是公司的股东，双方在出资范围内对公司承担责任，通过公司章程成立公司。
2、个人合作协议，双方根据合作协议承担责任、享受权利。可以存在于合伙等多种企业形式中。
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