1、如果企业与员工签订了服务期协议，或者禁业限制协议，并且劳动者有违约行为的，企业可以根据相关协议追求劳动者的违约责任。
2、如果员工自动离职确实给企业造成了损失，企业可以收集相关证据，向劳动者主张赔偿。需要说明的是，员工自动离职前，仍在正常上班期间的工资，企业不能无故扣发。经济补偿金可以在员工办理完毕交接工作后支付，但未规定工资也可以在办理完毕交接后才支付。
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