公司处理债务纠纷的方式是:1、协商和解,债权债务当事人在自愿互谅的基础上,直接进行协商或邀请第三人从中斡旋,解决纠纷;2、协商不成的,可向所在地的人民调解委员会提出书面调解申请;3、调解不成的,可以提起仲裁;4、仲裁无法解决的,可以收集相关证据向法院提起诉讼。