公司不承认股东享有股权的处理：
1、与公司进行协商。协商是解决纠纷、问题最直接有效的手段，要是能协商处理的最好协商处理。
2、委托专业公司法律师协助处理。
3、到法院起诉，股东应当以公司为被告，与案件争议股权有利害关系的人作为第三人。股东应当提供证据证明已经依法向公司出资，或者通过合法方式继受公司股权。
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