法人可以起诉自己公司。如果是和公司发生纠纷就起诉公司,如果是和老板发生纠纷起诉老板。公司的法人代表不是老板(所有权人)也属正常,法人代表代行法人或老板的资产承担民事责任与履行民事权利。
根据《公司法》第152条规定,董事、高级管理人员违反法律、行政法规或者公司章程的规定,损害股东利益的,股东可以向人民法院提起诉讼。