公司股权变更程序是:
1、有限责任公司变更股东的,应当自变更之日起30日内申请变更登记;
2、提交新股东的主体资格证明或者自然人身份证明,公司法定代表人签署的变更登记申请书,依照《公司法》作出的变更决议或者决定等。