大股东直接收购小股东的股份法律允许吗

允许的。只要小股东同意，并不对任何第三方构成伤害，当然是合法的。大股东协议价收购小股东股权，收购款可否从公司支出：不论大股东还是小股东在公司的出资都已转为公司资产。如果要收购应当是大股东另行用自有资金支付给小股东，并经过工商部门登进注册后原小股东的股份才可以转在大股东名下。必须严格区分股东持股与公司资产。股东的持股只是享有股权，但该部分股份出资属于公司资产，已不属于股东个人财产。