专利管理部门对当事人所提出的专利申请进行审查的流程有以下几个步骤：
1、初步审查，自申请日起满十八个月审查完毕；
2、初步公告；
3、实质审查，自申请日起三年内审查完毕；
4、授权专利，经过审查没有发现驳回理由的，发给发明专利证书，同时予以登记和公告。
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