合疗卡丢失后的补办流程为:持卡人本人向当地乡镇医院农合站申请挂失,然后根据农合办通知的补卡时间带本人身份证、参合票据等材料到农合办补卡窗口办理补卡手续。
国务院社会保险行政部门负责全国的社会保险管理工作,国务院其他有关部门在各自的职责范围内负责有关的社会保险工作。