计算擅自离职员工的工资:按照正常结算工资,但是单位不再支付补偿金以及赔偿金。若员工特殊理由擅自离职的,用人单位可以在结清工资后,可向员工要求赔偿造成的损失。
劳动者违反劳动合同法规定解除劳动合同,或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制,给用人单位造成损失的,应当承担赔偿责任。